「flutter build windows」でビルドしたところ、Release\data\flutter_assets\assetsフォルダにAssetsとして指定した内容がそのまますべて出力されてしまいました。
ファイル名もそのまま、普通に開くことができます。
これには驚きました。
ビルドのオブションなどで難読化することはできないようで、ここら辺を隠したい場合自力で作る必要があるようです。
windowsアプリはベータ版じゃないですよね?
ロードマップを見てもそこら辺のことは何も言及されていません。今更ですが不安になってきました。
https://github.com/flutter/flutter/blob/master/docs/roadmap/Roadmap.md
ということでここら辺をうまくパッケージ化出来たら需要があるかもしれません